Природните богатства на Бургас са безспорно една от причините градът да е предпочитано място за туризъм за хората от цял свят. „Морето събира всичко далечно“ – тази мисъл на Йоан Екзарх сякаш важи в пълна сила за Бургас. Откъдето и да го погледнете, Бургас е заобиколен от вода - солена и сладка. На изток е Черно море, а западно от морския бряг се намират три езера – Бургаско, Атанасовско и Мандренско – те образуват най-големия комплекс от крайморски езера в България и са обявени за защитени природни територии.
Бургаският залив притежава една от най-дългите плажни ивици с фин златист пясък, плавно морско дъно, спокойна и чиста вода, леки и приятни бризове. В Бургаския залив виреят около 140 различни вида риби. Над бургаските езера минава една от най-големите въздушни „магистрали“ на мигриращите прелетни птици от цяла Европа - Виа Понтика. До 300 000 щъркела прелитат ежегодно над града по време на есенната миграция. Това е мястото с най-голяма концентрация в Европа по време на прелет за розовия и къдроглавия пеликан, на тръстиковия блатар и на стотици други видове птици, някои от които защитени.
На 15 км. от центъра на града се намира друго природно богатство - Бургаските минерални бани – един от най-старите минерални извори с температура на водата 41,5 градуса. Южно от Бургас е разположен най-големият български природен парк - Странджа.